Préchauffer le four à 350°F (180 °C). Rouler la pâte sur une surface farinée. Foncer une assiette à tarte de l'une des abaisses. Réserver l'autre. Evider les pommes, les peler et les trancher.
Dans une casserole, amener l'eau à ébullition avec le sucre. Ajouter les pommes et laisser mijoter de 5 à 7 minutes. Incorporer la purée de citrouille et la garniture à fouetter. Poursuivre la cuisson 3 ou 4 minutes. Verser la préparation dans l'assiette à tarte.
Saupoudrer de cannelle et de muscade. Couvrir de la seconde abaisse et bien sceller. Pratiquer quelques incisions sur la tarte pour permettre à la vapeur de s'échapper pendant la cuisson. Cuire de 30 à 35 minutes environ, jusqu'à ce que la croûte soit dorée.